Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Riox1Q9JJF3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms