Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hmg20aQ9DC33 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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