Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Chmp5Q9D7S9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Chmp5Q9D7S9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Chmp5Q9D7S9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Chmp5Q9D7S9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Chmp5Q9D7S9 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Chmp5Q9D7S9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Chmp5Q9D7S9 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Chmp5Q9D7S9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Chmp5Q9D7S9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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