Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms