Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc81Q9D5W4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms