Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms