Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BccipQ9CWI3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BccipQ9CWI3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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