Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms