Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Nus1Q99LJ8 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Nus1Q99LJ8 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Nus1Q99LJ8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Nus1Q99LJ8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Nus1Q99LJ8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Nus1Q99LJ8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nus1Q99LJ8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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