Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms