Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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