Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Dnajc28Q8VCE1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Dnajc28Q8VCE1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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