Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rbm28Q8CGC6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rbm28Q8CGC6 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rbm28Q8CGC6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rbm28Q8CGC6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rbm28Q8CGC6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rbm28Q8CGC6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rbm28Q8CGC6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm28Q8CGC6 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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