Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Usp27Q8CEG8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Usp27Q8CEG8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Usp27Q8CEG8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Usp27Q8CEG8 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Usp27Q8CEG8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Usp27Q8CEG8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Usp27Q8CEG8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Usp27Q8CEG8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Usp27Q8CEG8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp27Q8CEG8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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