Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubqln3Q8C5U9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms