Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ccdc88cQ6VGS5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ccdc88cQ6VGS5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Ccdc88cQ6VGS5 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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