Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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