Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3cQ62181 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3cQ62181 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3cQ62181 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3cQ62181 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3cQ62181 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3cQ62181 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3cQ62181 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sema3cQ62181 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sema3cQ62181 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sema3cQ62181 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sema3cQ62181 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Sema3cQ62181 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms