Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms