Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

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Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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RelnQ60841 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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RelnQ60841 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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RelnQ60841 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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RelnQ60841 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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RelnQ60841 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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RelnQ60841 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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RelnQ60841 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RelnQ60841 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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RelnQ60841 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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RelnQ60841 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RelnQ60841 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RelnQ60841 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RelnQ60841 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RelnQ60841 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RelnQ60841 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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