Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mdc1Q5PSV9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mdc1Q5PSV9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms