Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fam208bQ5DTT3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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