Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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