Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Capn13Q3UW68 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Capn13Q3UW68 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Capn13Q3UW68 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Capn13Q3UW68 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms