Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm29609Q3UU56 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm29609Q3UU56 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm29609Q3UU56 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm29609Q3UU56 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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