Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Rmi2Q3UPE3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Rmi2Q3UPE3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
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