Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx27Q3UHD6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms