Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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