Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
StumQ0VBF8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms