Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Sh3bp2Q06649 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms