Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cxcr5Q04683 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms