Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms