Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Top2aQ01320 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms