Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms