Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Grin2cQ01098 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms