Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prop1P97458 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms