Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mesp1P97309 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms