Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms