Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxd13P70217 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Hoxd13P70217 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Hoxd13P70217 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Hoxd13P70217 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Hoxd13P70217 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Hoxd13P70217 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd13P70217 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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