Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Lmo4P61969 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Lmo4P61969 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Lmo4P61969 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Lmo4P61969 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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