Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ube2e3P52483 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2e3P52483 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms