Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mmp9P41245 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms