Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hoxa10P31310 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hoxa10P31310 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hoxa10P31310 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hoxa10P31310 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hoxa10P31310 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hoxa10P31310 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hoxa10P31310 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hoxa10P31310 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxa10P31310 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hoxa10P31310 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa10P31310 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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