Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RxraP28700 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
RxraP28700 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RxraP28700 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RxraP28700 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RxraP28700 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RxraP28700 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RxraP28700 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RxraP28700 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
RxraP28700 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RxraP28700 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RxraP28700 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RxraP28700 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RxraP28700 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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