Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18525 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18525 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18525 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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