Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm379J3QQ19 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms