Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc85cE9Q6B2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms