Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc8E9PWG2 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms