Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20521D3Z5F7 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms