Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms